クモハ123の 40番台車は、1987年１月に郵便荷物合造車のクモユニ147形から改造され、５両（ 41 - 45 ）が登場しました。
運転台直後に片開き扉を設けた２扉車で、外観・室内ともクモハ123-1に準じていますが、側面窓がやや大きくなり、戸袋窓は廃止されました。
また、ドア下部の張り出しが前位側（パンタグラフと逆側）にありました。
1989年に集約分散式冷房装置を２基搭載し、5040番台（5041 - 5045 ）に改番されましたが、5045のみは前面に貫通扉が追加され 5145に再改番されました。
その後も活躍を続けましたが、2006年から 2007年にかけて 313系に置き換えられる形で廃車となりました。
なお、塗装については、当初は白地に赤帯と前面に身延の頭文字（「Ｍ」）を図案化した模様でしたが、のちに 119系やキハ40系同様に白地にオレンジと緑の帯による塗装に変更されました。
鉄道コレクションでは、第20弾でデビュー当時の塗装・姿で「クモハ123-45」（語呂合わせが良い）を製品化しています。
↑ クモハ１２３－４５
↑ 前面の様子。身延の頭文字（Ｍ）を図案化したデザインです。
↑ 運転台付近側面の様子。
↑ 側面の様子。
↑ 反対側端（運転台付近）の様子。
↑ 反対側前面の様子。
↑ パンタグラフの様子。
↑ 台車の様子。
